中走絲線切割的穿絲孔的位置對于加工精度及切割速度關(guān)系甚大。通常，中走絲機床的穿絲孔的位置選在已知軌跡尺寸的交點處或便于計算的坐標(biāo)點上，以簡化編程中有關(guān)坐標(biāo)尺寸的計算，減少誤差。當(dāng)切割帶有封閉型孔的凹模工件時，穿絲孔應(yīng)設(shè)在型孔的中心，這樣既可準(zhǔn)確地加工穿絲孔，又較方便地控制坐標(biāo)軌跡的計算，但無用的切入行程較長。對于大的型孔切割，線切割機的穿絲孔可設(shè)在靠近加工軌跡的邊角處，以縮短無用行程。在切割凸模外形時，應(yīng)將穿絲孔選在型面外，設(shè)在靠近切割起始點處。切割窄槽時，穿絲孔應(yīng)設(shè)在圖形的zui寬處，不允許穿絲孔與切割軌跡發(fā)生相交現(xiàn)象。此外，在同一塊坯件上切割出兩個以上工件時，應(yīng)設(shè)置各自獨立的穿絲孔，不可僅設(shè)一個穿絲孔一次切割出所有工件。切割大型凸模時，有條件者可沿加工軌跡設(shè)置數(shù)個穿絲孔，以便切割中發(fā)生斷絲時能夠就近重新穿絲，繼續(xù)切割。 
中走絲線切割機床的穿絲孔的直徑大小應(yīng)適宜，一般為Φ2mm～Φ8mm。若孔徑過小，既增加鉆孔難度又不方便穿絲;若孔徑太大，則會增加鉗工工作量。如果要求切割的型孔數(shù)較多，孔徑太小，排布較為密集，應(yīng)采用較小的穿絲孔(Φ0.3mm～Φ0.5mm)，以避免各穿絲孔相互打通或發(fā)生干涉現(xiàn)象。